Консорциум по изучению генома утки, в который входят ученые из Китайского университета сельского хозяйства (China Agricultural University), КНР, Пекинского института генома (Beijing Genomics Institute — BGI), КНР, Эдинбургского университета (University of Edinburgh), Великобритания, а также другие научно-исследовательские учреждения, завершил секвенирование и анализ генома утки (Anas platyrhynchos) — одного из основных естественных резервуаров вирусов гриппа А, эпидемия которого разразилась в Китае в феврале 2013 г.
Новый штамм птичьего гриппа H7N9 стал причиной смерти 36 человек и принес убытки экономике Китая на 6,5 млрд дол. США. Утка как естественный резервуар вируса гриппа А, в том числе H5N1, известна своим врожденным иммунитетом к инфицированию вирусами птичьего гриппа. С целью выяснения механизмов взаимодействия вируса с организмом-хозяином ученые секвенировали геном пекинской утки в возрасте 10 нед и провели исследования по его расшифровке на двух вирус-инфицированных утках.
В работе впервые расшифрована последовательность генов водоплавающей утки, данные свидетельствуют о наличии в нем (как и в геномах кур и зябликов) сокращенного набора генов иммунного ответа в сравнении с таковым у млекопитающих. Кроме того, выявлены новые типы генов, отсутствующие в геноме кур, индеек и зябликов.
При сравнении экспрессии генов в легочной ткани утки, инфицированной патогенными штаммами вируса птичьего гриппа H5N1, идентифицированы гены с измененным ответом на вирусное воздействие. Идентифицированы также другие факторы, вовлеченные в формирование иммунного ответа утки как организма-хозяина на вирусную инфекцию, в том числе кланы защитных генов, характерные для птиц и млекопитающих.
Результаты исследования позволяют более глубоко понять механизмы иммунного взаимодействия вируса птичьего гриппа и организма-хозяина, что, в свою очередь, будет способствовать изучению факторов, влияющих на распространение вирусной инфекции, на качественно новом уровне.
BGI Shenzhen (2013) Duck genome provides new insight into fighting bird flu. ScienceDaily, June 10, (www.sciencedaily.com/releases/2013/06/130609195711.htm).
Huang Y., Li Y., Burt D.W. et al. (2013)The duck genome and transcriptome provide insight into an avian influenza virus reservoir species. Nature Genetics, June 9 [Epub ahead of print].
Ольга Федорова
