Открыты новые генетические варианты фенотипа липидного профиля

Международный консорциум ученых (International IBC Lipid Genetics Consortium), состоящий из более 180 исследователей со всего мира, в результате изучения дополнительных локусов, связанных с фенотипом липидов плазмы крови — холестерина липопротеинов высокой плотности (ХС ЛПВП), ХС липопротеинов низкой плотности (ЛПНП), общего ХС и триглицеридов, выявил новые варианты генов, связанных с риском возникновения кардиоваскулярной патологии и нарушений обмена веществ. Авторы этого крупнейшего метаанализа 32 полногеномных исследований (genome-wide association studies — GWASs) липидного фенотипа скоординировали свои усилия на базе Центра прикладной геномики при Детской больнице Филадельфии (Center for Applied Genomics at The Children’s Hospital of Philadelphia), Института кардиоваскулярной науки в Университетском колледже Лондона (Institute of Cardiovascular Sciences at University College London), Великобритания, и отделения кардиологии Университета Медицинского центра (Department of Cardiology at the University Medical Center) в Утрехте, Нидерланды.

Открытие стало возможным благодаря применению специального кардиочипа — устройства для анализа вариантов генов, изобретенного в 2006 г. Бренданом Дж. Китингом (Brendan J. Keating), научным сотрудником Центра прикладной геномики при Детской больнице Филадельфии (Center for Applied Genomics at The Children’s Hospital of Philadelphia). Инструмент содержит около 50 тыс. ДНК-маркеров для 2 тыс. генов-кандидатов, участвующих в развитии сердечно-сосудистых заболеваний. С момента создания кардиочипа исследователи применили его в десятках исследований.

В указанном метаанализе исследованы генетические данные 66 240 лиц европейского происхождения. В результате идентифицировано 4; 6; 10 и 4 неустановленных ранее варианта однонуклеотидного полиморфизма (single nucleotide polymorphism — SNP), связанных с уровнем ХС ЛПВП, ХС ЛПНП, общего ХС и триглицеридов соответственно. Также определено несколько видов связанных с липидами генов, о которых не сообщалось ранее: DGAT2, HCAR2, GPIHBP1, PPARG и FTO — для ХС ЛПВП, SOCS3, APOH, SPTY2D1, BRCA2 и VLDLR — для ХС ЛПНП, SOCS3, UGT1A1, BRCA2, UBE3B, FCGR2A, CHUK и INSIG2 — для общего ХС и SERPINF2, C4B, GCK, GATA4, INSR и LPAL2 — для триглицеридов.

Исследование включило самое большое количество образцов ДНК, когда-либо использовавшихся в изучении липидов. Хотя каждый из генетических вариантов оказывает незначительный эффект на конкретные особенности липидов, их сочетанное влияние может значительно повысить риск развития заболеваний.

В будущем исследователи планируют определить, какие из локусов генов ответственны непосредственно за причину болезни, чтобы целенаправленно поддерживать разработку новых лекарственных препаратов. Также планируется объединить ресурсы для выявления взаимодействия между генетическим полиморфизмом (одноосновные вариации ДНК) и биологическими маркерами, лежащими в основе развития сердечно-сосудистых заболеваний.

Исследование, опубликованное 11 октября 2012 г. в «American Journal of Human Genetics», позволит расширить поиск потенциальных терапевтических мишеней сердечно-сосудистых заболеваний, связанных с нарушениями липидного профиля как одной из ведущих причин смерти и инвалидности во всем мире.

Asselbergs F.W., Guo Y., van Iperen E.P.A. et al. (2012) Large-Scale Gene-Centric Meta-analysis across 32 Studies Identifies Multiple Lipid Loci. Am. J. Hum. Genet., October 11 [Epub ahead of print].

Children’s Hospital of Philadelphia (2012) Twenty-one genes tied to cholesterol levels identified. ScienceDaily, October 12 (www.sciencedaily.com­ /releases/2012/10/121011123959.htm).

Ивета Щербак